Kobberioner er giftig for akvarie- og damfisk, spesielt i vann med lav KH-verdi. Kobberioner brukes i en del over-disk medikamenter for behandling av bl.a. ciliatinfeksjoner. Kobberioner må fjernes ved delvannbytte etter avsluttet behandling. Kullfilter fjerner ikke kobberioner.
Giftige kobberioner kan også løses ut fra kobber-vannrør, spesielt fra varmtvannsrør. Arter som er spesielt følsomme er bl.a. Kuhli-ål og Ancistrus-arter.
Akseptable nivåer er <0,1 mg/L for fisk og <0,03 mg/L for reker.