Klamydiainfeksjoner hos fisk dukker opp som en viktig årsak til sykdom i nye og etablerte havbruksnæringer. Til dags dato har epitheliocystis, en hud- og gjellesykdom assosiert med infeksjon av disse obligate intracellulære patogenene, blitt beskrevet i over 90 fiskearter, inkludert fiskeverter fra marine- og ferskvannsmiljøer.
Mangelen på in vitro metoder for dyrking av klamydiapatogener fra fisk er en stor hindring for dette fagfeltet.
I akvariemiljøer kan man forsøksvis behandle infeksjoner med tetracykliner i vannet. Tetracykliner er reseptbelagte og må fåes via veterinær eller fiskehelsebiolog.