Det er mange bakterier i vannet i et akvarium. Mesteparten av tiden skader ikke disse bakteriene fisken din, da fiskens immunsystem avverger infeksjon. Faktisk spiller bakterier en viktig rolle i den generelle helsen til akvariets økosystem. Men når en fisk er stresset, kan immunforsvaret bli svekket, slik at bakterier tar tak og forårsaker sykdom. Bakterieartene som mest sannsynlig forårsaker finneråte er Aeromonas- , Pseudomonas-, Flavo- eller Vibrio- bakterier. Shewanella putrefaciens vokser ofte sammen med disse ved dyrking. Dyrking gjøres helst på TSA eller BHIA evt. på blodskål. Flavobakteriell infeksjon kan man mikroskopere seg frem til ellers krever disse medier med høyt vanninnhold ved dyrking.
Behandling: Støttebehandling for å lette osmoregulering er NORAQ Akvariesalt 0,5-1 g/L dvs. 1/2-1 måleskje per 10 liter akvarievann. For selve behandlingen benyttes helst antibiotikumet neomycin (reseptbelagt, kontakt en dyrlege), men over-disk produkter fra zooforretning som inneholder nifurpirinol kan også ha effekt. Det beste er å behandle ut i fra antibiogrammet, men ofte har man dårlig tid ved utbrudd - så da anbefales nifurpirinol eller neomycin.
Dosering, Neomycinsulfat: 6,6 g/100 liter (66 mg/L), med 2 dagers mellomrom inntil 3 ganger. Giftig for nitrifikasjonsflora, hold lav fisketetthet under behandlingen.